16年前,射手座黄金圣斗士伊奥·罗带着转世为真正女神的雅典娜逃出了圣域。在路上,他被双子座萨卡人和摩羯座修拉拦住,受了重伤。在命运的安排下,奄奄一息的艾欧罗斯将女神托付给了刚来喜马拉雅探险的日本城市财团总裁城户光政(大杉仁配音)。知道前因后果的郑光把女神带回了日本,给她取名为莎芝,并以孙女的名义抚养她长大。在命运和女神的感召下,经过艰苦的训练,圣斗士星矢(石川凯拓配音)、子龙(赤羽根健治配音)、冰川(小野贤章配音)和瞬间(冈本信彦配音)等少年相继回到日本,现在他们已经成长为独立的圣人。【/h/]与此同时,受教皇命令的刺客们陆续从避难所来到日本,一场可以载入史册的正义与邪恶的战争开始了...